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QUMA: QUantification tool for Methylation Analysis
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簡単に使えるバイサルファイト配列の解析ツールで、アライメント、
CpGメチル化状態の判定、図の作成といったことが短時間で行えます。

 list  概要と使い方 space  list  クイックスタート space  list  サンプル配列データでの実行 space  list  サンプル配列ファイル
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 list  バイサルファイトＰＣＲのターゲットのゲノム配列のファイルを選択して下さい。
(plain sequence、 FASTAまたは GenBank形式の配列ファイルが使用可能です。)
ＰＣＲプライマー間のゲノム配列を、 CをTに変換せずに 用いて下さい。		 space
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 list  バイサルファイト配列のファイルを選択して下さい。
(multi-FASTA形式の配列ファイル、または 配列ファイルが入った
 zip形式のアーカイブ（圧縮フォルダ）が使用可能です。)
シークエンサーからの出力配列をそのまま使用可能です。プラスミドベクター配列の除去は必要ありません。		 space
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 list 解析を再開する場合はQUMAリストアファイル(.qma)を選択して下さい。 space   help
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    What's New
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  • ２０１９年５月１５日、２０１４年７月１９日、２０１４年１月１６日、２０１３年４月９日
    • マイナーな変更
  • ２０１２年１０月２５日
    • マイナーなバグの修正
  • ２０１２年８月２３日
    • バイサルファイト配列のファイルとしてABI形式のファイル（".ab1"の拡張子を持つ波形データファイル）が使えるようになりました
  • ２０１２年５月２３日
    • バイサルファイト配列の同一性のチェックのオプションを追加しました (上にある「オプションを表示する」をクリックすると現われます)
  • ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)が発信している 統合TVに「QUMAを使い倒す」が掲載されています。 QUMAの使い方が動画で解説されていますので、是非ご覧下さい（特に初めてQUMAを使用される方）。
  • 以前のNews
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  • ファイアフォックス（マック／ウィンドウズ）
  • サファリ（マック）
  • オペラ（マック／ウィンドウズ）
  • インターネットエクスプローラー（ＩＥ）６．０以上（ウィンドウズ）（但しＩＥ７、８はバグが多いのでお勧めしません）
ＩＥ５．０（ウィンドウズ）、モジラ、ネットスケープ６以上など、多くのブラウザーで問題なく使えると思います。
ただし、ＭａｃのＩＥやネットスケープ４など、古いブラウザーでは正しく表示できない場合があります。
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ご意見、ご感想、不具合情報等ありましたら、ぜひ 
quma@cdb.riken.jp
  までお知らせ下さい。
機能についてのリクエストや使用方法がわからないといった場合でもお気軽にお問い合わせ下さい。
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最終更新日時：Wed May 15 19:00:00 JST 2019 spacer QUMA (QUantification tool for Methylation Analysis) top