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space titile QUMA (QUantification tool for Methylation Analysis) top
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QUMAのプログラムのソースコードやライブCD/DVDを用いることで
セキュアにQUMAを使うことが可能になります!
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    ライブCD/DVD版のQUMAのダウンロード
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ライブCD/DVD(起動ディスク)版のQUMAを用いることで、 簡単(インストールやセットアップは必要なく、CD/DVDを入れてパソコンを起動するだけ)、 安全(パソコンのハードディスクの内容を書き換えずに使用可能で、インターネットへの接続も必要ないためセンシティブなデータの取り扱いにも安心です)に、 必要なときに空いているパソコンで QUMAサーバーを研究室内に立ち上げることが可能です。QUMAの使用後は再起動すれば、パソコンは元通りに使用できます。
QUMAのライブCD/DVDからパソコンを起動すると、自動的にQUMAのウェブサーバーが立ち上がり、 画面にQUMAサーバーのURLが表示されます。このQUMAサーバーはLAN内(研究室内や研究所内) の他のパソコンからアクセスが可能ですが、LAN外からはアクセスできません(ファイアウォール等が設置されている場合に限りますが、 ほとんど全ての学校・研究所・企業でファイアウォールが設置されています)。
ライブCD/DVD版のQUMAは、もっとも有名なライブCD/DVD LinuxであるKNOPPIX、 及び、その日本語版をベースに作製しています。 KNOPPIXについての詳細はKNOPPIX - Wikipedia等をご覧下さい。
ライブCD/DVD版のQUMAは、ウィンドウズパソコンとIntelMacで使用できます。 ウィンドウズパソコンは全ての機種ではありませんが多くの機種で使用可能です。IntelMacは最新機種では使用できない機種もありますが、 初期のIntelMacでは使用できる機種が多いようです。
QUMAのversion 1.1.13 (2013年4月9日公開)をベースにしています。ダウンロードには数十分~数時間が必要です。
KNOPPIX 7.0.2 DVD (日本語版)ベース iso DVD イメージファイル (4.0 GB) md5チェックサムファイル
KNOPPIX 7.0.5 CD (英語版)ベース iso CD イメージファイル (694 MB) md5チェックサムファイル
KNOPPIX 7.0.5 DVD (英語版)ベース iso DVD イメージファイル (4.0 GB) md5チェックサムファイル
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これらのiso CD/DVD イメージファイルは、ダウンロードしてダブルクリックすれば、多くの場合はCD/DVDを作製するためのソフトウェアが起動し、CD/DVDに焼くことができます。 日本語キーボード(JIS配列)のパソコンには日本語版を用いて下さい。
機種により異なりますが、ウィンドウズパソコンでは、起動時にF12キーや、F8キー、Delキー、Tabキーを押すことで、 CD/DVD起動を選択できる機種が多いようです(起動時の画面にどのキーを押すか表示してあったり、パソコンの取扱説明書に書いてあります)。
IntelMacでは、起動時にCキーを押すことで、CD/DVDからの起動ができます。
ライブCD/DVD版のQUMAはGNU General Public Licence (GPLv3)で公開しています。
過去ダウンロードファイル
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    QUMAのプログラムソースコードのダウンロード
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QUMAのプログラムソースコードを用いることで、研究所レベルでQUMAのサーバーを立ち上げることが可能になります。 QUMAはプログラム言語のPerlで書かれており、ローカルにインストールすることが可能です。 QUMAは多くのLinuxのディストリビューション、Mac OS X, ウィンドウズ 2000/XP(ただしcygwinを使用)で 動作することが確認されており、またほとんど全てのUNIX系のOSで動作すると思います。 QUMAのインストールとセットアップはそんなに難しくはありませんが、 UNIXやLinuxのウェブサーバをセットアップできる程度のスキルは必要です。(すみません。 つまり多くの生物・医学のWetの研究者にはかなり難しいです。上述のライブCD/DVD版を用いてください。) Mac OS Xやウィンドウズでのセットアップは、事前にインストールしなければ行けないプログラムが多いため、 多くのLinuxディストリビューションへのセットアップよりも難しいです。
最新ダウンロードファイル (Version 1.1.15 2014年7月19日公開):
プログラムソースコード (18.8 MB), md5チェックサムファイル, READMEファイル
QUMAのプログラムソースコードはGNU General Public Licence (GPLv3)で公開しています。
過去ダウンロードファイル
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    QUMAのCharacter-Based User Interface vsrsionのダウンロード
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ダウンロードファイル (Version 1.0.0 2010年10月22日公開):
プログラムファイル (24 KB), md5チェックサムファイル, READMEファイル
QUMA CUI versionはGNU General Public Licence (GPLv3)で公開しています。

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