サービス停止予定のお知らせ
いつもQUMAをご利用頂きありがとうございます。電気設備年次点検に伴う停電のため、
2010年12月4日(土)午前8時~午後4時にQUMAのサービスを停止させて頂く予定です。ご了承下さい。
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QUMA: QUantification tool for Methylation Analysis
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簡単に使えるバイサルファイト配列の解析ツールで、アライメント、
CpGメチル化状態の判定、図の作成といったことが短時間で行えます。

 list  概要と使い方 space  list  クイックスタート space  list  サンプル配列データでの実行 space  list  サンプル配列ファイル
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 list  バイサルファイトPCRのターゲットのゲノム配列のファイルを選択して下さい。
(plain sequenceFASTAまたは GenBank形式の配列ファイルが使用可能です。)
PCRプライマー間のゲノム配列を、 CをTに変換せずに 用いて下さい。
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 list  バイサルファイト配列のファイルを選択して下さい。
(multi-FASTA形式の配列ファイル、または 配列ファイルが入った
 zip形式のアーカイブ(圧縮フォルダ)
が使用可能です。)
シークエンサーからの出力配列をそのまま使用可能です。プラスミドベクター配列の除去は必要ありません。
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space space space ホームページに行くspaceQUMA (QUantification tool for Methylation Analysis) top
 list 解析を再開する場合はQUMAリストアファイル(.qma)を選択して下さい。 space   help
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    What's New
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  • 2010年11月12日
    • フィッシャーの正確確率検定のパフォーマンスを改善しました
  • 2010年10月22日
    • Character-Based User Interface versionのQUMAを公開しました
  • ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)が発信している 統合TVに「QUMAを使い倒す」が掲載されています。 QUMAの使い方が動画で解説されていますので、是非ご覧下さい(特に初めてQUMAを使用される方)。
  • 実験医学2009年9月号の「クローズアップ実験法」に 「QUMAを用いたバイサルファイト法によるDNAメチル化解析」を執筆しました。 QUMAの使い方のヒントも記載していますので、ご参考にして頂ければと思います。
  • 以前のNews
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    サポートしているウェブブラウザー
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以下のウェブブラウザーをサポートしています
  • ファイアフォックス(マック/ウィンドウズ)
  • サファリ(マック)
  • オペラ(マック/ウィンドウズ)
  • インターネットエクスプローラー(IE)6.0以上(ウィンドウズ)(但しIE7はバグが多いのでお勧めしません)
IE5.0(ウィンドウズ)、モジラ、ネットスケープ6以上など、多くのブラウザーで問題なく使えると思います。
ただし、MacのIEやネットスケープ4など、古いブラウザーでは正しく表示できない場合があります。
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    連絡先
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  熊木 勇一 & 岡野 正樹
  理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター 哺乳類エピジェネティクス研究チーム
  〒650-0047 神戸市中央区港島南町2-2-3
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spacer 理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター 哺乳類エピジェネティクス研究チーム
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quma@cdb.riken.jp
  までお知らせ下さい。
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最終更新日時:Fri Nov 12 23:58:32 JST 2010 spacer QUMA (QUantification tool for Methylation Analysis) top